Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms