Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ParpbpQ6IRT3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms