Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt40Q6IFX3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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