Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms