Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6GQU0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6GQU0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6GQU0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms