Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms