Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms