Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ric1Q69ZJ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ric1Q69ZJ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms