Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk13Q69ZA1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk13Q69ZA1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms