Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkp4Q68FH0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms