Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms