Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4fQ66X05 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4fQ66X05 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms