Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Arhgef39Q66JY6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Arhgef39Q66JY6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Arhgef39Q66JY6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Arhgef39Q66JY6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Arhgef39Q66JY6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Arhgef39Q66JY6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Arhgef39Q66JY6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Arhgef39Q66JY6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Arhgef39Q66JY6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Arhgef39Q66JY6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Arhgef39Q66JY6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Arhgef39Q66JY6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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