Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnna3Q65CL1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnna3Q65CL1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms