Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp9Q64HY3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms