Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2bQ64511 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms