Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf1Q64213 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms