Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms