Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Aebp1Q640N1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Aebp1Q640N1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Aebp1Q640N1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Aebp1Q640N1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Aebp1Q640N1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Aebp1Q640N1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Aebp1Q640N1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Aebp1Q640N1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Aebp1Q640N1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aebp1Q640N1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Aebp1Q640N1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms