Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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Ccdc18Q640L5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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Ccdc18Q640L5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
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Ccdc18Q640L5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
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Ccdc18Q640L5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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Ccdc18Q640L5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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Ccdc18Q640L5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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Ccdc18Q640L5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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Ccdc18Q640L5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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Ccdc18Q640L5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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