Protein–RNA interactions for Protein: Q63959

Kcnc3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc3Q63959 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc3Q63959 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc3Q63959 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms