Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CochQ62507 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CochQ62507 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CochQ62507 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CochQ62507 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CochQ62507 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CochQ62507 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CochQ62507 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CochQ62507 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CochQ62507 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CochQ62507 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CochQ62507 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CochQ62507 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CochQ62507 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CochQ62507 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CochQ62507 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CochQ62507 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CochQ62507 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms