Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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