Protein–RNA interactions for Protein: Q62376

Snrnp70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp70Q62376 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp70Q62376 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrnp70Q62376 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms