Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf6Q62311 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms