Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms