Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms