Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sycp1Q62209 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp1Q62209 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms