Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms