Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhocQ62159 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms