Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a2Q62148 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms