Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms