Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga7Q61738 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga7Q61738 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms