Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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AtrxQ61687 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms