Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli3Q61602 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms