Protein–RNA interactions for Protein: Q61475

Cd55, Complement decay-accelerating factor, GPI-anchored, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55Q61475 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd55Q61475 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd55Q61475 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd55Q61475 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd55Q61475 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd55Q61475 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms