Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms