Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irf9Q61179 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irf9Q61179 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf9Q61179 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf9Q61179 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf9Q61179 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms