Protein–RNA interactions for Protein: Q61115

Ptch1, Protein patched homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch1Q61115 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptch1Q61115 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptch1Q61115 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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