Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms