Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc1Q61056 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms