Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift20Q61025 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms