Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf3Q60765 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms