Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SkiQ60698 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms