Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PtprnQ60673 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PtprnQ60673 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PtprnQ60673 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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PtprnQ60673 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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PtprnQ60673 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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PtprnQ60673 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PtprnQ60673 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PtprnQ60673 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PtprnQ60673 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PtprnQ60673 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprnQ60673 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms