Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Akap4Q60662 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Akap4Q60662 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms