Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms