Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncoa4Q5U4H9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncoa4Q5U4H9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms