Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms