Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms